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“とんちんかんは、鍛冶などで師が鉄を打つ間に弟子が槌を入れるため、ずれて響く音の「トンチンカン」を模した擬音語であった。
音が揃わないことから、ちぐはぐなことを意味するようになり、さらに間抜けを意味するようになった。
漢字で「頓珍漢」と書くのは当て字である。”

- 頓珍漢（とんちんかん） - 語源由来辞典 (via petapeta)